本作主人公，个子矮小的少年，12岁取得国家炼金术师资格，拥有“钢”之称号。右手与左脚为机械义肢，为了见到去世的母亲，和弟弟阿尔冯斯一起进行了人体炼成，结果失去了弟弟的身体与自己的手脚，为了找回失去的...
本作的另一个主人公，爱德华的弟弟，原本是个金发金眼的人类少年，因在尝试复活母亲使用人体炼成时失败，结果整个身体都被夺走，爱德以右臂为代价换回了他的灵魂，只能让灵魂寄生在冰冷的钢铁盔甲里。
本作女主角，失去了父母的她从小和祖母一起生活，与爱德和阿尔青梅竹马。对机械铠和跟机械铠有关的一切事物感兴趣，与祖母比拿可一样成为机械铠工程师，是爱德的专属技师。对艾尔利克兄弟来说是等同于家人的重要...
400年前成功制造出贤者之石，能将灵魂转移到另一人的身体继续生存，可是在一次进行灵魂转移，失去抵抗肉体恶化，但丁400年前相恋的对象，并将而让你死去的炼成人造人。因不希望让妻子夏看见开始腐烂的身体，所以...
但丁的弟子，为了让死去的孩子复活，她触犯了禁忌，进行人体炼成因而失去身体的一部分，不能再生育。至此之后也让她下定不轻易使用炼金术的决心。但是被艾尔利克兄弟真挚眼神打动的她，成为了两兄弟的师傅。
伊修巴尔人，因为额头有交叉伤痕，因而被称作“伤疤人”（斯卡即Scar，并非本名）。右手是他哥哥留给他的未完成的贤者之石，可以爆炸破坏任何物质，为了向金布利证明人类体内不是空空如也而分解自己的左手。
上校军衔，拥有‘焰’之称号的国家级炼金术师，杀害温莉父母的凶手，在东方司令部的军队任职。私底下处处保护着艾尔利克兄弟。在挚友死后，马斯坦古开始暗中调查他被杀的原因，得知了“贤者之石”的真相。
中尉军衔，效命于东方司令部，马斯坦的副官，她总是陪伴在罗伊身边处理事务。有着远超于常人的高超枪法于时刻沉着冷静的性格，在加上不留情面的率真与语气，令周围人对她又怕又敬，跟随马斯坦出生入死到最后。
中校军衔，中央军阀会议所任职，和罗伊是多年的老友，是个非常爱老婆和孩子的好男人。看上去吊儿郎当，但头脑反应极快，对遇到困难的人总是忍不住伸出援手。因协助艾尔利克兄弟调查第五研究所而无意间发现了人造...
少校军衔，有着‘豪腕’之称号的国家级炼金术师，只有一个妹妹。炽热到沸腾的肌肉体魄，总是毫无意义地热血男儿情，以及动不动就热泪的魄力。后配合马斯坦在北方发动兵变。
大总统，立下汗马功劳而成为独裁者，指挥大规模的歼灭作战，四处发动战争，将人推向绝望的深渊，从而产生贤者之石的原材料和制造者。
大总统的左右手之一，铁血无情，可炼成包覆全身的多管炮座攻击。在伊修瓦尔内乱时，要求马可医生提供贤者之石试作品给各国家炼金术师，作为炼成增幅剂，向马斯坦古下令处决温莉的父母。实际上第五研究所的负责人。
中校，有着‘红莲’之称号的国家级炼金术师，原为地方军队所属的军人，喜欢使用炼金术将人体变成炸弹。杀死斯卡哥哥和在斯卡前额留下伤痕的凶手。
继任死去的休斯中校一职。向大总统提出了作为战争武器投入合成兽的人。后晋升为上校，在斯卡的炼成阵里失去一半身体，因而身体的一半机械化。
指挥并支配人造人的幕后黑手。伊兹米的老师，霍恩海姆400年前相恋的对象。从400年前转移身体后变得长寿，但在灵魂转移过程中由于灵魂的劣化肉体会老化。为了进行灵魂转移，需要贤者之石的力量，因此她透过人造人...
原为斯卡的哥哥的恋人，十多年前斯卡的哥哥为了复活恋人而进行人体炼成的产物，后被但丁接收并任命为第二代拉丝特，心如蛇蝎，但一直希望能成为真正的人类。
原为爱慕但丁的青年，死后被但丁以血红之石进行人体炼成的产物。虽由但丁亲手制造，但不想受限于血红之石，渴望永恒的生命而背叛，于是掳走阿尔想要研究想获得长生不老的生命，但结果遭金布利跟塔卡背叛和拉丝特...
原为艾尔利克兄弟为使母亲复活而进行人体炼成的产物，被但丁找出且喂食血红之石，可化为液状游走，顶替在伊修瓦尔内乱前两年死亡的茱丽叶·道格拉斯上尉身份，以大总统秘书官身份在军部活动。
原为但丁制造血红之石的产物。拉丝特死后，但丁为控制意识混乱的格拉托尼，消去其舌头上的衔尾蛇刺青，使他只会为了食欲而行动。
原为霍恩海姆及但丁两人因汞中毒而死去之子，霍恩海姆为使他复活而进行了人体炼成，有着喜欢欺骗夺取伤害他人的残虐个性，因认为霍恩海姆抛弃了自己而对他和艾尔利克兄弟产生嫉恨，一直都在追杀霍恩海姆。声称已...
原是伊兹米死去的婴儿，送入“门”内进行人体炼成，其后独自从门里逃出，被但丁接收为人造人，把斯洛斯当作母亲。在爱德杀死斯洛斯后，要求但丁复活斯洛斯却反遭切除原不属他的手足，在被温莉装上机械铠后去向不...
大总统金·布拉德雷，但丁引以自豪的“杰作”，可看见空气的流动，同样有者再生能力。在但丁授意下四处发动战争，将人推向绝望的深渊，从而产生贤者之石的原材料和制造者。
